آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشکده علوم و فناوری زیستی

معرفی آزمایشگاه:
آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی دانشکده علوم و فناوری زیستی با هدف توسعه روشهای محاسباتی در علوم زیستی مولکولی فعالیت میکند و تمرکز اصلی آن بر مدلسازی ساختاری، شبیهسازیهای دینامیک مولکولی و طراحی دارو است. پژوهشهای ما به بررسی شبیهسازیهای دینامیک مولکولی برای مطالعه برهمکنشهای پروتئین-لیگاند اختصاص دارد. علاوه بر این، در زمینه غربالگری مجازی، اصلاح پپتید، و طراحی دارو با در نظر گرفتن تغییرات پساترجمهای، بهویژه گلیکوزیلاسیون، فعالیت داریم. همچنین، تحقیقات ما شامل مطالعات داكینگ مولكولی و محاسبات انرژی آزاد اتصال در کمپلکسهای پروتئین-لیگاند میشود.
همکاری علمی، رکن اساسی رویکرد پژوهشی ماست. با تعامل نزدیک با متخصصان شیمی و زیستشناسی، در تلاشیم تا فرضیات قابل آزمون را پیشنهاد داده و اعتبارسنجی کنیم که به پیشرفت حوزه کشف دارو کمک کند. آزمایشگاه ما محیط پژوهشی پویایی را فراهم میکند که در آن روشهای نظری و کاربردی بیوانفورماتیک برای پاسخ به پرسشهای اساسی زیستشناسی مولکولی و علوم دارویی به کار گرفته میشوند.
در حال حاضر، این آزمایشگاه متشکل از ۱۰ پژوهشگر شامل دانشجویان دکتری، کارشناسی ارشد و کارشناسی است که در طیف وسیعی از مطالعات محاسباتی مشارکت دارند. با بهرهگیری از همکاریهای میانرشتهای و ابزارهای محاسباتی پیشرفته، هدف ما ارائه دستاوردهای علمی ارزشمند در حوزه بیوانفورماتیک ساختاری، شبیهسازیهای مولکولی و مدلسازی ساختاری زیستمولکولها است.
همکاری علمی، رکن اساسی رویکرد پژوهشی ماست. با تعامل نزدیک با متخصصان شیمی و زیستشناسی، در تلاشیم تا فرضیات قابل آزمون را پیشنهاد داده و اعتبارسنجی کنیم که به پیشرفت حوزه کشف دارو کمک کند. آزمایشگاه ما محیط پژوهشی پویایی را فراهم میکند که در آن روشهای نظری و کاربردی بیوانفورماتیک برای پاسخ به پرسشهای اساسی زیستشناسی مولکولی و علوم دارویی به کار گرفته میشوند.
در حال حاضر، این آزمایشگاه متشکل از ۱۰ پژوهشگر شامل دانشجویان دکتری، کارشناسی ارشد و کارشناسی است که در طیف وسیعی از مطالعات محاسباتی مشارکت دارند. با بهرهگیری از همکاریهای میانرشتهای و ابزارهای محاسباتی پیشرفته، هدف ما ارائه دستاوردهای علمی ارزشمند در حوزه بیوانفورماتیک ساختاری، شبیهسازیهای مولکولی و مدلسازی ساختاری زیستمولکولها است.
تجهیزات ثبت شدهی آزمایشگاه در شبکه آزمایشگاهی فناوریهای راهبردی:
ID آزمایشگاه | نام آزمایشگاه | ID | ID نوع دستگاه | نوع دستگاه | ID مدل دستگاه | مدل دستگاه | آخرین وضعیت |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2517 | آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم و فناوری زیستی | 43740 | 4613 | نرم افزار تجسم ساختار مولکولی کایمرا - Chimera Molecular Structure Visualization Software | 26721 | chimera-1.18 - UCSF RBVI - ایالات متحده آمریکا | آماده سرويس دهی |
2517 | آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم و فناوری زیستی | 43739 | 4612 | نرم افزار تجسم ساختار مولکولی بایوویا - BIOVIA Discovery Studio Molecular Structure Visualization Software | 26720 | Discovery Studio 2024 Client - Dassault Systèmes - فرانسه | آماده سرويس دهی |
2517 | آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم و فناوری زیستی
|
43738 | 4611 | نرم افزار تجسم مولکولی پایمول - PyMOL Molecular Visualization Software | 26719 | PyMOL 3.0 - Schrödinger - ایالات متحده آمریکا | آماده سرويس دهی |
2517 | آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم و فناوری زیستی | 43737 | 4610 | نرم افزار شبیه سازی مولکولی اوتوداک - Molecular Modeling Simulation Software | 26718 | Autodock 4 - AutoDock - ایالات متحده آمریکا | آماده سرويس دهی |
2517 | آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم و فناوری زیستی | 43736 | 4609 | نرم افزار شبیه سازی دینامیک مولکولی امبر - Amber Molecular Dynamics | 26717 | AmberTools24 - Amber Molecular Dynamics - ایالات متحده آمریکا | آماده سرويس دهی |
2517 | آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم و فناوری زیستی | 43735 | 4608 | نرم افزار شبیه سازی دینامیک مولکولی گرومکس - Gromacs Molecular Dynamics | 26716 | GROMACS 2024.3 - MD Tutorials - هلند | آماده سرويس دهی |
2517 | آزمایشگاه زیست شناسی محاسباتی - دانشگاه شهید بهشتی دانشکده علوم و فناوری زیستی
|
43734 | 4607 | نرم افزار شبیه سازی دینامیک مولکولی وی ام دی - Visual Molecular Dynamics Software | 26715 | VMD 1.9.3 - Theoretical and Computational Biophysics Group - ایالات متحده آمریکا | آماده سرويس دهی |