مقالات علمی چاپ شده در مجلات

1. "Insights into co-expression network analysis of microProteins and their target transcription factors in plant embryo development"
   Khadijeh Shokri, Naser Farrokhi, Asadollah Ahmadikhah, Mehdi Safaeizadeh, Mousavi Amir
   Current Bioinformatics, Vol. 19, pp.1-12, 2024
2. "Investigation of viruses infecting Lycopersicum esculentum in Iran and molecular analysis of Cucumber mosaic virus"
   Mehdi Safaeizadeh, Abbas Saeidi
   journal of plant, algae, and environment, Vol. 8, pp.1325-1336, 2024
3. "Comparative RNA-seq analysis of Arabidopsis thaliana response to AtPep1 and flg22, reveals the identification of PP2-B13 and ACLP1 as new members in pattern-triggered immunity"
   Mehdi Safaeizadeh, Thomas Boller, Claude Becker
   PLoS One, Vol. 19, pp.1-33, 2024
4. "Evaluation of the Hormonal Changes in the Model Plant Arabidopsis thaliana as the Consequence of Pseudomonas aeruginosa Infection"
   Mehdi Safaeizadeh, Ali Akbar Ghotbi-Ravandi
   journal of plant, algae, and environment, Vol. 7, pp.1213-1227, 2023
5. "Differential expression of the genes encoding immune system components in response to Pseudomonas syringae and Pseudomonas aeruginosa in Arabidopsis thaliana"
   Abbas Saeidi, Mehdi Safaeizadeh, Zohreh Hajibarat
   3 Biotech, Vol. 14, pp.1-17, 2023
6. "Endogenous Peptide Signals in Arabidopsis thaliana, their receptors and their role in innate immunity"
   Mehdi Safaeizadeh
   Journal of Plant Molecular Breeding, Vol. 9, pp.1-11, 2022
7. "In silico analysis and molecular investigation of the nuclear shuttle protein-interacting kinase 1 (NIK1) in six Solanaceous species"
   Mehdi Safaeizadeh, Nachelli Malpica
   Cold Spring Harbor Molecular Case Studies, 2021
8. "Transcriptomic profiling uncovers new players in innate immunity in Arabidopsis thaliana"
   Mehdi Safaeizadeh, Thomas Boller, Claude Becker
   Cold Spring Harbor Molecular Case Studies, Vol. 1, pp.1-45, 2021
9. "First report of cucumber mosaic virus infecting Dianthus hybridus in Iran"
   Mehdi Safaeizadeh
   JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY, Vol. 104, 2021
10. "Differential and tissue-specific activation pattern of the AtPROPEP and AtPEPR genes in response to biotic and abiotic stress in Arabidopsis thaliana"
    Mehdi Safaeizadeh, Thomas Boller
    Plant Signaling & Behavior, Vol. 14, pp.1-17, 2019
11. "ارزیابی سیگنال دهی جاسمونات در آرابیدوپسیس از نوع وحشی و جهش یافته تحت تنش شوری، خشکی، IAA، ABA و سودوموناس آئروژینوزا"
    عباس سعیدی، مهدی صفائی زاده، زهرا حاجی برات
    بیوتکنولوژی کشاورزی، نسخه 16، صفحات:1-22، 1403
12. "آنالیز in silico ژن 6- فروکتوز ترانسفراز در .Triticum aestivum L"
    معصومه فلاح زیارانی، مهدی صفائی زاده
    زیست فناوری گیاهان زراعی، نسخه 11، صفحات:75-92، 1401

مقالات علمی ارائه شده در همایش‌ها

1. "Studying the antifungal effects of cannabis and rosemary exosomes EVs on Phytophtera"
   Mohammad sadegh Abbasi, Naser Farrokhi, Mehdi Safaeizadeh
   6th International Congress and 18th Iranian Genetics Congress, 2024
2. "Gene expression analysis of WRKY40 in Arabidpsis thaliana following exposure to Active and Inactive Pseudomonas syringae treatments"
   Yeganeh Altafi, Mehdi Safaeizadeh, Ali Akbar Ghotbi-Ravandi
   6th International Congress and 18th Iranian Genetics Congress, 2024
3. "Bioinformatic investigation of protein stability WRKY40 in Arabidopsis thaliana"
   Yeganeh Altafi, Mehdi Safaeizadeh, Ali Akbar Ghotbi-Ravandi
   6th International Congress and 18th Iranian Genetics Congress, 2024
4. "Plant-derived extracellular vesicles: Bioactive compounds, biological function, engineering and their application in agriculture and biomedicine"
   Mohammad sadegh Abbasi, Homa Zarabizadeh, Mojgan Latifi, Naser Farrokhi, Mehdi Safaeizadeh
   6th International Congress and 18th Iranian Genetics Congress, 2024
5. "Analysis of PR1 protein stability in Arabidopsis thaliana using Bioinformatic Techniques"
   Yeganeh Altafi, Mehdi Safaeizadeh, Ali Akbar Ghotbi-Ravandi
   6th International Congress and 18th Iranian Genetics Congress, 2024
6. "AtPEP3 small Signal peptide can enhance the components of innate immunity same as the AtPROPEP1 peptide signaling in the genetic model Arabidopsis thaliana"
   Mehdi Safaeizadeh, ZAHRA SOLTANNAVAZI, Abbas Saeidi
   Iran's 5th Conference on Protein and Peptide Science, 2024
7. "Bovine serum albumin facilitates the adequate ligand perception by its corresponding receptor AtPEPR1 and trigger the robust innate immunity response in Arabidopsis thaliana"
   Mehdi Safaeizadeh, ZAHRA SOLTANNAVAZI
   The 6th International and 8th national IASBS Symposium in Biological Sciences: Ligand Binding, 2024
8. "AtPEPR1 receptor can perceive the nanomlar ratio of AtPep1 ligand and activate the immune system in the genetic model Arabidopsis thaliana"
   Mehdi Safaeizadeh, ZAHRA SOLTANNAVAZI, Abbas Saeidi
   The 6th International and 8th national IASBS Symposium in Biological Sciences: Ligand Binding, 2024
9. "Identification and investigation of some genes coding for receptors involved in immune response for human and Arabidopsis thaliana models a bioinformatics study"
   Mohammad sadegh Abbasi, ZAHRA SOLTANNAVAZI, Maryam Rezaei, Mehdi Safaeizadeh
   The 6th International and 8th national IASBS Symposium in Biological Sciences: Ligand Binding, 2024
10. "Downregulation of PCAT-1 long non-coding RNA in children with autism spectrum disorder"
    Vera Ebrahimi, Zeinab Shirvani, Mehdi Safaeizadeh
    the 7th international congress on Biomedicine, 2023
11. "Curcumin modulate gene expression in colon cancer-bearing Mus musculus: A meta-analysis of RNA-seq data"
    Ali Najafi, Mehdi Safaeizadeh, Asadollah Ahmadikhah, Mohammad Mahdi Gabileh
    the 7th international congress on Biomedicine, 2023
12. "Bioinformatics investigation of protein stability Mitogen activated protein kinase 3 (MAPK3)"
    Mehdi Safaeizadeh, Masoumeh Fallah ziarani
    the 7th international congress on Biomedicine, 2023
13. "Reduction of PCAT-29 long non-coding RNA in children with Autism Spectrum Disorder"
    Vera Ebrahimi, Zeinab Shirvani, Mehdi Safaeizadeh
    the 7th international congress on Biomedicine, 2023
14. "Bioinformatic investigation of protein stability PEX6"
    Mehdi Safaeizadeh, Masoumeh Fallah ziarani
    the 7th international congress on Biomedicine, 2023
15. "Meta-analysis of gene expression changes in MCF7 cell lines treated with EGCG and apigenin"
    Ali Najafi, Mehdi Safaeizadeh, Asadollah Ahmadikhah, Mohammad Mahdi Ghabileh
    the 7th international congress on Biomedicine, 2023
16. "In silico analysis of the second and third structure of the immune receptor FLAGELLIN SENSITIVE-2"
    Mehdi Safaeizadeh, Masoumeh Fallah ziarani, Fatemeh Bamdad, Farshad Daevishi
    The 6th international congress on biomedicine, 2022
17. "Evaluation of the stability of the immune receptor FLAGELLIN SENSITIVE-2"
    Mehdi Safaeizadeh, Masoumeh Fallah ziarani, Fetemeh Bamdad, Farshad Daevishi
    The 6th international congress on biomedicine, 2022
18. "Investigating the effect of oil-eating bacteria Pseudomonas aerogenosa on the change of hormones in the model plant Nicotiana benthamiana"
    Fatemeh Bamdad, Mehdi Safaeizadeh, Masoumeh Fallah ziarani
    , 2022
19. "Bioinformatic analysis of the secondary and tertiary structure of protein 6-fructose transferase in wheat"
    Masoumeh Fallah ziarani, Mehdi Safaeizadeh, Fatemeh Bamdad
    , 2022
20. "جایگاه عوامل مختلف تنظیمی در مراحل تکوین بذر در گیاه Brassica napus با تاکید بر روی microProteins و microRNA"
    خدیجه شکری، ناصر فرخی، اسداله احمدی خواه، مهدی صفائی زاده
    پنجمین همایش بین المللی و سیزدهمین همایش ملی بیوتکنولوژی ایران، 1402
21. "متاآتالیز داده های بیانی بافت های مختلف گیاه شاهدانه(Cannabis sativa)"
    علی راعی، اسداله احمدی خواه، مهدی صفائی زاده
    پنجمین همایش بین المللی و سیزدهمین همایش ملی بیوتکنولوژی ایران، 1402
22. "متاآنالیز تاثیر متابولیت گیاهی ثانویه Licochalcone A بر روی داده های میکروآرای باکتری Staphylococcus aureus تیمار شده در مقایسه با آنتی بیوتیک های NovobiocinM و Daptomycine"
    علی نجفی، مهدی صفائی زاده، اسداله احمدی خواه
    پنجمین همایش بین المللی و سیزدهمین همایش ملی بیوتکنولوژی ایران، 1402
23. "آنالیز و بررسی گیرنده های سلولی TLRهای انسانی با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی"
    محمدصادق عباسی، عاطفه امینی نیسیانی، مهدی صفائی زاده
    پنجمین همایش بین المللی و سیزدهمین همایش ملی بیوتکنولوژی ایران، 1402
24. "معرفی میکروپروتئین های کاندیدای آرابیدوپسیس تالیانا درگیر در پاسخ به تنش غیرزیستی"
    خدیجه شکری، اسداله احمدی خواه، مهدی صفائی زاده، ناصر فرخی
    دوازدهمین همایش سراسری کشاورزی و منابع طبیعی پایدار، 1402
25. "Investigating the morphological effect of salicylic acid treatment on resistance to pathogenic bacteria in Nicotiana Rustica"
    مهدی صفائی زاده، عاطفه امینی نیسیانی، عباس سعیدی
    دهمین کنگره ملی گیاهان دارویی، 1402
26. "Investigation of hormonal changes in Arabidopsis thaliana plant under the effect of biological stress by Pseudomonas aeruginosa"
    مهدی صفائی زاده، علی اکبر قطبی راوندی، معصومه فلاح زیارانی
    دهمین کنگره ملی گیاهان دارویی، 1402
27. "Bioinformatic investigation of protein stability CMV Cucumber mosaic virus"
    مهدی صفائی زاده، عباس سعیدی، معصومه فلاح زیارانی
    دهمین کنگره ملی گیاهان دارویی، 1402
28. "Bioinformatic investigation of protein stability Calmodulin-binding Protein 60 g (CBP60g) Cucumber mosaic virus"
    مهدی صفائی زاده، معصومه فلاح زیارانی، یگانه الطافی، علی اکبر قطبی راوندی
    دهمین کنگره ملی گیاهان دارویی، 1402
29. "بررسی تاثیر تیمار سودوموناس سرنژیه وباکتری سودوموناس آروژینوزا ومخمر ساکارومایسس سرویزیه بر گیاه آرابیدوپسیس تالیانا با استفاده از میکروسکوپ الکترونی"
    مهدی صفائی زاده، فاطمه بامداد، معصومه فلاح زیارانی، مهدی جهانفر
    پنجمین کنگره بین المللی و هفدهمین گنگره ملی ژنتیک ایران، 1401
30. "بررسی اثر تلقیح سودوموناس سرنژیه بر روی هورمون های گیاه نیکوتینا تاباکوم"
    مهدی صفائی زاده، فاطمه بامداد، معصومه فلاح زیارانی، فرشاد درویشی
    پنجمین کنگره بین المللی و هفدهمین گنگره ملی ژنتیک ایران، 1401
31. "بررسی اثر تلقیح سودوموناس آرژینوزا بر هورمون های گیاهی نیکوتینا تاباکوم"
    مهدی صفائی زاده، فاطمه بامداد، معصومه فلاح زیارانی، فرشاد درویشی
    پنجمین کنگره بین المللی و هفدهمین گنگره ملی ژنتیک ایران، 1401
32. "بررسی اثر تلقیح ساکارومایسس سرویزیه بر هورمون های گیاه نیکوتینا تاباکوم"
    مهدی صفائی زاده، فاطمه بامداد، معصومه فلاح زیارانی، فرشاد درویشی
    پنجمین کنگره بین المللی و هفدهمین گنگره ملی ژنتیک ایران، 1401
33. "بررسی تاثیر تنش شوری (کلرید سدیم) بر بیان خانواده ژنی AtPropeps در آرابیدوپسیس تالیانا"
    مهدی صفائی زاده
    بیست و یکمین کنگره ملی و نهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران، 1399
34. "بررسی تاثیر باکتری نفت خوار Pseudomonas aeruginosa بر تحریک سیستم ایمنی آرابیدوپسیس تالیانا"
    مهدی صفائی زاده، داریوش مینایی طهرانی
    بیست و یکمین کنگره ملی و نهمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران، 1399